环保部门:
对向水体直排污水的企事业单位违反水环境管理制度，故意不正常使用水污染物处理设施以及造成水污染事故等违法行为进行查处。（详见《中华人民共和国水污染防治法》、《中华人民共和国水污染防治法实施细则》）

水行政管理部门：
污水纳入城市污水管网的企事业单位的污水处理，河道整治。

渔政部门：
渔业、渔船污染防治。

地质矿产资源部门：
地下水污染的监督管理。

经济综合主管部门：
对生产、销售、进口或者使用禁止的设备或工艺的行为的查处。